2020-09-24 23:26:00
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GOLD是一款由英国剑桥大学晶体数据中心开发的一款分子对接程序。GOLD是一个计算大分子与小分子结合模式的分子对接程序,是Sheffield大学,laxoSmithKline公司和CCDC协作的产物。

基本信息

  • 中文名称

    Gold

  • 类型

    分子对接程序

  • 开发单位

    剑桥大学

  • 国家

    英国

折叠 编辑本段 软件

GOLD是一款由英国剑桥大学晶体数据中心开发的一款分子对接程序。GOLD是一个计算大分子与小分子结合模式的分子对接程序,是Sheffield大学,laxoSmithKline公司和CCDC协作的产物。因其准确性和可靠性在分子模拟圈内评价很高。

GOLD的遗传算法最适合虚拟筛选和并行计算。

发布的版本可在商业的PCGRID系统上使用。它采用遗传算法(GA)进行蛋白-配体对接;对接时配体完全柔性和蛋白部分柔性;能量函数部分依赖于来自CSD数据库的构象和非键接触;打分函数有GoldScore、ChemScore和用户自己定义的打分函数;多种限制选项;对接结果后处理工具:SILVER;自动考虑活性口袋内结合的水分子;改进的处理金属配位结构方法;对特别的配体自动衍生GA设置。

清华大学、中科院上海药物研究所等大型科研单位都已引进该软件,与LigandScout配套使用。国内大多生物药物企业生产药品是将国外过期专利廉价打包购买回来宣称填补国内空白,很少有能力在药物方面进行尖端科研。Gold是进行尖端科研必备软件之一。

折叠 编辑本段 光学软件包

GOLD-自主开发的复杂光学系统分析优化软件包

GOLD是我校在国家自然科学基金委员会的长期支持下研制成功的大型光学设计软件包。它可以对各种光学系统进行像质分析和结构优化,其适用范围囊括了国内外用于光学成像系统设计制造的各种技术。

在GOLD软件研制发展的不同阶段,先后通过了由中国光学学会名誉理事长王大市院士和理事长母国光院士主持的部级鉴定,被评为"理论新颖、计算可靠、功能齐全、使用方便,为我国光学设计的发展作出了重要贡献,达到国际先进水平并处于国际前列地位"。有关的获奖项目包括:《非常规复杂光学系统计算机辅助设计的研究》成果获1991年度中国科学院科技进步二等奖,《军用光电光学系统的像质评价和结构优化》获1996年度部级科技进步H等奖,《近代复杂光学系统的优化设计及在光电工程中的应用》获1998年度国家科技进步王等奖。

1992年以来,GOSA-GOLD软件已在国内大范围推广使用,用户单位包括中国科学院、中国工程物理研究院、国防科工委、教育部所属的绝大多数光学研究单位,也有许多工厂企业,已应用本程序成功地设计研制了多种光学系统。在国防领域中,其应用范围涵盖了卫星、飞机、导弹、坦克、舰船、防空系统各个方面,许多属于国家重点项目;有关生产企业也用其设计了照相器材、医疗仪器、体视显微镜、投影电视等许多产品。广大用户单位一致给予GOSA-GOLD软件高度评价,认为它"功能齐全,性能优良","计算可靠,使用方便",是"不可多得的优秀光学设计软件","工作中不可缺少的工具",用其"解决了许多以往未能解决的问题","为项目的顺利完成奠定了基础"。充分说明本研究成果正在为我国国防科研和光学工业的发展发挥着重要的作用。

GOLD软件分析优化的复杂光学系统,可以含有各种复杂曲面、复杂棱镜和复杂光栏;可以含有菲涅尔透镜、光栅、全息、二无光学、渐变折射率等特殊元件;可以含有们心、倾斜元件和各种扫描机构相成非共输光路;可以带有曲面物、像面;也可以是各种多重结构系统,即包括可变焦镜头、多光路系统、在不同光波段上使用的系统、用附加镜头改变放大率的系统,等等。当然,程序同样可以处理最普通的共轴球面系统。同时,本程序对光学系统的总面数没有限制,只要求所有(独立)系统参数的总和不超过1000个。

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